Мировой обзор

Страна Огня. Конохагакуре но Сато и другие территории государства.

После смерти Сарутоби Хирузена - Третьего Хокаге, Листом в первое время правит Совет старейшин, после чего правление переходит к Цунаде. Наруто и Джирайя, после трехлетнего отсутствия, возвращаются в селение.
На протяжении нескольких месяцев ситуация в деревне остается стабильной и спокойной. "Корень" действует в тайне ото всех, следуя собственным целям.

В мае 999 года, группа неизвестных, проникнув в Коноху, выходит на Узумаки Наруто, с целью его захвата и активации Девятихвостого прямо в центре селения. Фальшивые улики, подброшенные преступниками, указывают на причастность Киригакуре. В ходе расследования, с участием Кисараги Сецуны, Узумаки Наруто и Хьюга Хинаты, удаётся узнать, что особая конфигурация клинков, принадлежащих арестованным, использовалась не только в Кири, но и в Сора но Куни.
Эпизод "Охота на крыс >>

Недалеко от Конохи была найдена шахта с кристаллами чакры, которую нелегально использовало бандитское формирование. Теперь селение получает неплохую прибыль с продажи кристаллов другим странам и использует материал в своих нуждах. Попытки вынести часть сырья контрабандой уже не раз пресекались местными шиноби.

В связи с появлением клана Кодаймуши, организовавшего визит в Коноху и оказавшегося родственным клану Абураме, между ними возникли разногласия в виду запутанной родословной. Никто не знает, чем всё может закончится.

Отправленная в ночной патруль, команда №10, обнаружила в небе 5 летящих фигур с крыльями и начала преследование. На одной из полян, неизвестные приземлились, чтобы кому-то передать важный груз. Попытка захватить одного из летунов оказалась проваленной, в результате чего захваченный шиноби был убит кем-то из своих, остальные, сбежали с грузом. Команда №10 запустила в небо сигнальную ракету, подняв на ноги поисковые отряды. Оставшиеся металлические крылья, которые использовал враг, были доставлены Хокаге. По всем признакам, они принадлежат "Черному солнцу".

Майто Гай и Узумаки Наруто удачно спасли посла Ивагакуре из лап бандитов, шантажировавших мэра г. Отафуку, куда посол отправился с дипломатическим визитом.

Информация о таинственном происхождении и появлении шахты кристаллов на территории страны Огня доходит до"Черного солнца" через свои каналы. Оказывается, кристаллы растут в так называемой точке соприкосновения двух измерений и являются чужеродным продуктом. Скрытый портал в другой мир, чрезвычайно богатый энергией - весьма ценная добыча, чтобы ее упустить. "Черное солнце" руками подчиненного им формирования начало спецоперацию по внедрению своих агентов в другое измерение и захвату самого портала.
Но, операция не увенчалась успехом. Потеряв немало людей и вынудив вмешаться в бой Жабьего Отшельника Джирайю, "Черное солнце" вынуждено было отступить. Учиха Саске, Инузука Хитоми, Драгон Умаре и Узумаки Наруто, добравшись до портала, попали в другое измерение. Через некоторое время, один из Жабьих Мудрецов смог их разыскать и вернуть обратно, кроме Наруто, которого забрал на гору Мёбоку для обучения.

Страна Ветра. Сунагакуре но Сато и другие территории государства.

Суной правит Сабаку но Гаара. Жители и совет разделились на два лагеря, ходят волнения, по поводу нового Каге с темным прошлым. Селение постепенно налаживает политические отношения с Листом. Недавно, кто-то совершил диверсию на водонапорной станции, вывел ее из строя, дабы лишить деревню воды. С какой целью это было сделано, пока неизвестно. Оказавшиеся в селении и остановившиеся на ночлег, Наруто и Хината, не могут бросить друга в беде. Они успешно спасают Суну от множества проблем, связанных с водоснабжением, но диверсант подрывает себя, оставив лишь осколок кулона с загадочным символом, который послужит важной зацепкой в будущем.
Эпизод "Без воды нет деревни"

Страна Воды. Киригакуре но Сато и другие территории государства.

Туманом правит Мэй Теруми. Селение постепенно оживает после кровавого периода и старается очистить свое имя. Живы некоторые представители клана Мурамаса, в виду чего возможны изменения во внутренней и внешней политике Мизу но куни. Хатаке Какаши и Узумаки Наруто расследуют исчезновение научно-исследовательского судна страны Огня близ одного из островов Воды, но на начальном этапе сталкиваются в порту Кири с кланом Мурамаса, устроившем нападение на деревню.
Итогом битвы является отступление клана и смерть его главы от руки сына. Изгнанник, стертый со страниц истории Киригакуре, но помешавший нападению своих сородичей на Мизукаге, попадает в отдел дознания.
Коноховцы отправляются в страну Неба для дальнейших поисков, к сожалению, не увенчавшихся успехом.
Спустя немного времени, Умидан Мурамаса, ныне Мэталл становится Айнкаге. В глазах жителей он герой, ныне защищающий селение и являющийся правой рукой Теруми Мэй. Казалось бы, для Кири наступила эпоха стремительного развития, но всё же нашлись те, кто намеренно или следуя глупым убеждениям решили затормозить процесс, организовав череду загадочных событий, одним из которых явился крупный теракт с применением биологического оружия, названным впоследствии "Пожирателем".
Эпизод "пожиратель"
В ходе расследования и борьбы с "Пожирателем", Вектор и Райто нашли виновных и причины теракта. Против заразы был разработан антидот, ныне применяемый в Киригакуре и предложенный другим странам на саммите Каге, в обмен на иные, ценные товары во избежание масштабных конфликтов. Нить одного дела постепенно привела Вектора и Райто к другому. Выяснилось, что первыми распространителями заразы являются "спящие" агенты - люди с подчиненной волей и разумом около трех десятилетий назад, вследствие применения на них ныне закрытой программы "Абаддон", запущенной еще предыдущим Дайме. Нынешнему правителю страны вместе с Вектором и Райто выпала честь разгребать последствия. 43 "спящих" агента должны быть найдены.
Эпизод "Спящие агенты"
Вскоре, в Кири раскрывается внутренний заговор в рядах контрразведки, заинтересованной в продолжении использования запрещенной программы. Вектор ликвидирует некоторых "спящих", а после, став жертвой первого опыта подчинения воли, теряет над собой контроль. В результате последствий, его заключают под стражу и "промывают мозги", однако, его временный напарник - Одзаки Райто, тайно помогает ему сбежать.
После этого, агенты контрразведки заставляют Райто хранить молчание по этому делу, во избежание серьезных последствий для дорогих ему людей. В ответ на это, Одзаки тайно изобретает средство массового погружения в сон, которое может пустить в ход, если контрразведка переступит черту.
Металл Умидан и Вектор решают взять дело в свои руки. Они осуществляют грамотно продуманную операцию, в исходе которой разоблачают внутренний заговор в рядах контрразведки страны Воды и зачищают гнездо преступников, чтобы закрыть зомби-программу "Абаддон", начатую предыдущим дайме и пожелавшим ее окончания нынешним правителем.

Страна Молнии. Кумогакуре но Сато и другие территории государства.

Облаком правит Эй Йотсукэ. Внутри селения жизнь идет своим чередом, однако враги окружают извне. Райкаге начал борьбу с преступной организацией "Черное солнце", о которой узнал совсем недавно, после того, как один из его подчиненных, предал его, убив одного из ценных шиноби Молнии по приказу "Черного солнца". С каждым днем они крепнут, но о их существовании до недавнего времени, знал только Райкаге и ограниченный круг его доверенных лиц. На последнем саммите Каге, созванном Теруми Мэй по делу "Пожиратель", Райкаге решил поделиться известной ему информацией о новом враге, что окончательно подтвердило причастность выходцев страны Неба ко многим терактам и незаконной деятельности в других странах.

Что происходит сейчас см. в "Секретные материалы."

Страна Земли. Ивагакуре но Сато и другие территории государства.

Ивой правит Рьётенбин но Оноки. Между Каге и советом наблюдаются разногласия. Группа радикалов хотела развязать войну между Ивой и Конохой. Дабы предотвратить это, команда Листа под руководством опытного бойца отправилась к штабу организации и выполнила миссию успешно.

Что происходит сейчас см. в "Секретные материалы."

Страна Дождя. Амегакуре но Сато и другие территории государства.

Дождем правят Пейн и Конан. Селение залечивает раны после гражданской войны. Экономика постепенно идет вверх. Каге продолжает стремиться к цели достижения мира с соседними странами.
Не так давно, Нагато при помощи Учиха Ламиноко и своего джоунина - Касумия Сюнсуке проник на территорию острова, где обитает Треххвостый и договорился с ним о передаче части его чакры, чтобы поддержать свое изможденное тело. Позднее, из уст Ламиноко, Мизукаге узнала о произошедшем, но так как Санби не пострадал, а у Учиха просто не было выбора перед Пейном, Теруми не стала предъявлять Пейну претензии.
Спустя около месяца после этого события, а также после побега Учиха из Кири, Пейн решает принять ее в ряды своих шиноби. Вероятно для того, чтобы иметь подспорье перед Учиха Обито, который после развала Акацуки (в результате выхода Пейна из ее состава), создал культ  "Мугенмё".

Что происходит сейчас см. в "Секретные материалы."

Страна Снега. Юкигакуре но Сато и другие территории государства.

Команда №7 в прежнем составе встречается в селении Снега. Несмотря на то, что у Учиха Саске иные причины визита в эти края, старые друзья объединяются, чтобы выяснить, кто крадет энергию генератора, истощая защитные свойства "купола весны". По словам свидетелей, моменты падения мощности совпадают с появлением летающей тени в небесах во время снежной бури. Все ниточки приводят правителя Юки - Казахану и команду Конохи на место временной стоянки  новой Анкор Вантиан. На это указывают, утерянные в спешке, металлические крылья новой модификации, какие использовали шиноби Сора но Куни.
Эпизод "Призраки Севера".